1 | #include <stdlib.h> |
---|
2 | #include <stdio.h> |
---|
3 | #include <time.h> |
---|
4 | #include <frams/virtfile/stdiofile.h> |
---|
5 | |
---|
6 | #include <frams/model/model.h> |
---|
7 | #include <frams/genetic/defgenoconv.h> |
---|
8 | #include <frams/errmgr/stdouterr.h> |
---|
9 | #include <frams/virtfile/stringfile.h> |
---|
10 | |
---|
11 | StdoutErrorHandler err; //redirect model-related errors to stdout |
---|
12 | DefaultGenoConvManager gcm; //without this object the application would only handle "format 0" genotypes |
---|
13 | |
---|
14 | int main(int argc,char*argv[]) |
---|
15 | { |
---|
16 | SString gen(argc>1?argv[1]:"X[|G:1.23]"); |
---|
17 | if (!strcmp(gen,"-")) |
---|
18 | { |
---|
19 | gen=0; |
---|
20 | StdioFILEDontClose in(stdin); |
---|
21 | loadSString(&in,gen); |
---|
22 | } |
---|
23 | Geno g(gen); |
---|
24 | printf("\nSource genotype: '%s'\n",(const char*)g.getGene()); |
---|
25 | printf(" ( format %c %s)\n", |
---|
26 | g.getFormat(), (const char*)g.getComment()); |
---|
27 | |
---|
28 | Model m(g);//.getConverted('0')); |
---|
29 | |
---|
30 | if (!m.isValid()) |
---|
31 | { |
---|
32 | printf("Cannot build Model from this genotype!\n"); |
---|
33 | return 2; |
---|
34 | } |
---|
35 | printf("Converted to f0:\n%s\n",(const char*)m.getF0Geno().getGene()); |
---|
36 | |
---|
37 | printf("\nusing Param::save() to create the \"expanded\" form of the f0 genotype...\n(MultiParamLoader should be able to load this)"); |
---|
38 | |
---|
39 | StringFILE2 f; |
---|
40 | |
---|
41 | static Param modelparam(f0_model_paramtab); |
---|
42 | static Param partparam(f0_part_paramtab); |
---|
43 | static Param jointparam(f0_joint_paramtab); |
---|
44 | static Param neuroparam(f0_neuro_paramtab); |
---|
45 | static Param connparam(f0_neuroconn_paramtab); |
---|
46 | |
---|
47 | modelparam.select(&m); |
---|
48 | modelparam.save(&f,&SString("m")); |
---|
49 | |
---|
50 | Part *p; |
---|
51 | Joint *j; |
---|
52 | Neuro *n; |
---|
53 | |
---|
54 | for (int i=0;p=(Part*)m.getPart(i);i++) |
---|
55 | { |
---|
56 | partparam.select(p); |
---|
57 | partparam.save(&f,&SString("p")); |
---|
58 | } |
---|
59 | for (int i=0;j=(Joint*)m.getJoint(i);i++) |
---|
60 | { |
---|
61 | jointparam.select(j); |
---|
62 | jointparam.setParamTab(j->usedelta?f0_joint_paramtab:f0_nodeltajoint_paramtab); |
---|
63 | jointparam.save(&f,&SString("j")); |
---|
64 | } |
---|
65 | for (int i=0;n=(Neuro*)m.getNeuro(i);i++) |
---|
66 | { |
---|
67 | neuroparam.select(n); |
---|
68 | neuroparam.save(&f,&SString("n")); |
---|
69 | } |
---|
70 | for (int a=0;n=(Neuro*)m.getNeuro(a);a++) |
---|
71 | { // inputs |
---|
72 | for (int b=0;b<n->getInputCount();b++) |
---|
73 | { |
---|
74 | double w; |
---|
75 | NeuroConn nc; |
---|
76 | Neuro* n2=n->getInput(b,w); |
---|
77 | nc.n1_refno=n->refno; nc.n2_refno=n2->refno; |
---|
78 | nc.weight=w; |
---|
79 | nc.info=n->getInputInfo(b); |
---|
80 | connparam.select(&nc); |
---|
81 | connparam.save(&f,&SString("c")); |
---|
82 | } |
---|
83 | } |
---|
84 | |
---|
85 | printf("\n============================\n%s\n",(const char*)f.getString()); |
---|
86 | |
---|
87 | return 0; |
---|
88 | } |
---|
89 | |
---|
90 | /*********************** EXAMPLE OUTPUT ********************************* |
---|
91 | |
---|
92 | Source genotype: 'X[|G:1.23]' |
---|
93 | ( format 1 ) |
---|
94 | Converted to f0: |
---|
95 | p: |
---|
96 | p:1 |
---|
97 | j:0, 1, dx=1 |
---|
98 | n:p=1 |
---|
99 | n:j=0, d="|:p=0.25,r=1" |
---|
100 | n:j=0, d=G |
---|
101 | c:0, 2, 1.23 |
---|
102 | c:1, 0 |
---|
103 | |
---|
104 | |
---|
105 | using Param::save() to create the "expanded" form of the f0 genotype... |
---|
106 | (MultiParamLoader should be able to load this) |
---|
107 | ============================ |
---|
108 | m: |
---|
109 | se:1 |
---|
110 | Vstyle: |
---|
111 | |
---|
112 | p: |
---|
113 | x:0 |
---|
114 | y:0 |
---|
115 | z:0 |
---|
116 | m:1 |
---|
117 | s:1 |
---|
118 | dn:1 |
---|
119 | fr:0.4 |
---|
120 | ing:0.25 |
---|
121 | as:0.25 |
---|
122 | rx:0 |
---|
123 | ry:0 |
---|
124 | rz:0 |
---|
125 | i: |
---|
126 | Vstyle:part |
---|
127 | |
---|
128 | p: |
---|
129 | x:1 |
---|
130 | y:0 |
---|
131 | z:0 |
---|
132 | m:1 |
---|
133 | s:1 |
---|
134 | dn:1 |
---|
135 | fr:0.4 |
---|
136 | ing:0.25 |
---|
137 | as:0.25 |
---|
138 | rx:0 |
---|
139 | ry:0 |
---|
140 | rz:0 |
---|
141 | i: |
---|
142 | Vstyle:part |
---|
143 | |
---|
144 | j: |
---|
145 | p1:0 |
---|
146 | p2:1 |
---|
147 | rx:0 |
---|
148 | ry:0 |
---|
149 | rz:0 |
---|
150 | dx:1 |
---|
151 | dy:0 |
---|
152 | dz:0 |
---|
153 | stif:1 |
---|
154 | rotstif:1 |
---|
155 | stam:0.25 |
---|
156 | i: |
---|
157 | Vstyle:joint |
---|
158 | |
---|
159 | n: |
---|
160 | p:1 |
---|
161 | j:-1 |
---|
162 | d:N |
---|
163 | i: |
---|
164 | Vstyle:neuro |
---|
165 | |
---|
166 | n: |
---|
167 | p:-1 |
---|
168 | j:0 |
---|
169 | d:|:p=0.25,r=1 |
---|
170 | i: |
---|
171 | Vstyle:neuro |
---|
172 | |
---|
173 | n: |
---|
174 | p:-1 |
---|
175 | j:0 |
---|
176 | d:G |
---|
177 | i: |
---|
178 | Vstyle:neuro |
---|
179 | |
---|
180 | c: |
---|
181 | n1:0 |
---|
182 | n2:2 |
---|
183 | w:1.23 |
---|
184 | i: |
---|
185 | |
---|
186 | c: |
---|
187 | n1:1 |
---|
188 | n2:0 |
---|
189 | w:1 |
---|
190 | i: |
---|
191 | |
---|
192 | |
---|
193 | *************************************************************************/ |
---|